Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA1P21709 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms