Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGCP20142 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGCP20142 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGCP20142 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGCP20142 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGCP20142 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGCP20142 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGCP20142 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGCP20142 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGCP20142 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGCP20142 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGCP20142 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGCP20142 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGCP20142 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGCP20142 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGCP20142 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGCP20142 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGCP20142 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGCP20142 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGCP20142 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGCP20142 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGCP20142 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGCP20142 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGCP20142 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGCP20142 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGCP20142 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGCP20142 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGCP20142 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGCP20142 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGCP20142 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGCP20142 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGCP20142 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGCP20142 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGCP20142 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGCP20142 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGCP20142 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGCP20142 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGCP20142 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGCP20142 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGCP20142 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGCP20142 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGCP20142 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGCP20142 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGCP20142 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGCP20142 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGCP20142 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGCP20142 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGCP20142 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGCP20142 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGCP20142 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGCP20142 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGCP20142 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms