Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT4P19013 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT4P19013 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT4P19013 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT4P19013 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT4P19013 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT4P19013 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT4P19013 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT4P19013 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT4P19013 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT4P19013 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT4P19013 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT4P19013 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT4P19013 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT4P19013 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT4P19013 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT4P19013 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT4P19013 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT4P19013 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT4P19013 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT4P19013 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT4P19013 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT4P19013 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT4P19013 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT4P19013 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT4P19013 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT4P19013 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT4P19013 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT4P19013 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT4P19013 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT4P19013 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT4P19013 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT4P19013 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT4P19013 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT4P19013 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT4P19013 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT4P19013 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT4P19013 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT4P19013 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT4P19013 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT4P19013 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT4P19013 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT4P19013 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT4P19013 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT4P19013 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT4P19013 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT4P19013 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT4P19013 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT4P19013 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT4P19013 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT4P19013 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT4P19013 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT4P19013 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT4P19013 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT4P19013 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT4P19013 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT4P19013 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT4P19013 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT4P19013 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT4P19013 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT4P19013 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT4P19013 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT4P19013 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT4P19013 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT4P19013 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT4P19013 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT4P19013 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT4P19013 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT4P19013 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT4P19013 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT4P19013 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT4P19013 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT4P19013 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT4P19013 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT4P19013 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT4P19013 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT4P19013 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT4P19013 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT4P19013 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT4P19013 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT4P19013 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT4P19013 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT4P19013 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT4P19013 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT4P19013 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT4P19013 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms