Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF3P17036 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF3P17036 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF3P17036 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms