Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCF3P15923 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF3P15923 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF3P15923 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF3P15923 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCF3P15923 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF3P15923 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF3P15923 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF3P15923 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF3P15923 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF3P15923 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF3P15923 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF3P15923 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF3P15923 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF3P15923 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF3P15923 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF3P15923 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF3P15923 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF3P15923 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF3P15923 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF3P15923 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF3P15923 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF3P15923 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF3P15923 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF3P15923 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF3P15923 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF3P15923 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF3P15923 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF3P15923 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF3P15923 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF3P15923 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF3P15923 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF3P15923 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF3P15923 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF3P15923 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF3P15923 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF3P15923 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF3P15923 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF3P15923 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF3P15923 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF3P15923 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF3P15923 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF3P15923 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF3P15923 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF3P15923 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF3P15923 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF3P15923 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF3P15923 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF3P15923 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF3P15923 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF3P15923 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF3P15923 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF3P15923 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF3P15923 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF3P15923 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF3P15923 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF3P15923 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF3P15923 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF3P15923 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF3P15923 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF3P15923 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF3P15923 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF3P15923 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF3P15923 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF3P15923 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF3P15923 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF3P15923 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF3P15923 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF3P15923 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF3P15923 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF3P15923 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF3P15923 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF3P15923 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF3P15923 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF3P15923 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF3P15923 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF3P15923 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF3P15923 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms