Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOLR1P15328 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOLR1P15328 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOLR1P15328 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOLR1P15328 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms