Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFD2P13995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTHFD2P13995 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFD2P13995 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFD2P13995 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFD2P13995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms