Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNT1P13805 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNT1P13805 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNT1P13805 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms