Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH1P12830 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH1P12830 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH1P12830 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH1P12830 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH1P12830 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH1P12830 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH1P12830 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH1P12830 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH1P12830 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH1P12830 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH1P12830 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH1P12830 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH1P12830 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH1P12830 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH1P12830 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH1P12830 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH1P12830 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH1P12830 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH1P12830 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH1P12830 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH1P12830 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH1P12830 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH1P12830 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH1P12830 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH1P12830 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH1P12830 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH1P12830 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH1P12830 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH1P12830 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH1P12830 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH1P12830 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH1P12830 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH1P12830 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH1P12830 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH1P12830 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH1P12830 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH1P12830 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH1P12830 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH1P12830 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH1P12830 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH1P12830 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH1P12830 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH1P12830 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH1P12830 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH1P12830 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH1P12830 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH1P12830 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH1P12830 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH1P12830 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH1P12830 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH1P12830 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH1P12830 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH1P12830 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH1P12830 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH1P12830 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH1P12830 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH1P12830 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH1P12830 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH1P12830 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH1P12830 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH1P12830 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH1P12830 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH1P12830 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH1P12830 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH1P12830 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH1P12830 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH1P12830 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH1P12830 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH1P12830 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH1P12830 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH1P12830 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH1P12830 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH1P12830 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH1P12830 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH1P12830 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms