Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BMP3P12645 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BMP3P12645 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BMP3P12645 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BMP3P12645 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BMP3P12645 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BMP3P12645 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BMP3P12645 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BMP3P12645 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BMP3P12645 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BMP3P12645 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BMP3P12645 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BMP3P12645 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BMP3P12645 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BMP3P12645 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BMP3P12645 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BMP3P12645 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BMP3P12645 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BMP3P12645 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BMP3P12645 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BMP3P12645 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BMP3P12645 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BMP3P12645 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BMP3P12645 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BMP3P12645 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BMP3P12645 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BMP3P12645 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BMP3P12645 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BMP3P12645 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BMP3P12645 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BMP3P12645 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BMP3P12645 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BMP3P12645 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BMP3P12645 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BMP3P12645 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BMP3P12645 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BMP3P12645 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BMP3P12645 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BMP3P12645 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BMP3P12645 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BMP3P12645 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BMP3P12645 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BMP3P12645 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BMP3P12645 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BMP3P12645 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BMP3P12645 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BMP3P12645 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BMP3P12645 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BMP3P12645 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BMP3P12645 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BMP3P12645 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BMP3P12645 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BMP3P12645 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BMP3P12645 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BMP3P12645 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BMP3P12645 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BMP3P12645 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BMP3P12645 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BMP3P12645 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BMP3P12645 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BMP3P12645 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BMP3P12645 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BMP3P12645 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BMP3P12645 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BMP3P12645 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BMP3P12645 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BMP3P12645 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BMP3P12645 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BMP3P12645 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BMP3P12645 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BMP3P12645 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BMP3P12645 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BMP3P12645 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BMP3P12645 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BMP3P12645 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BMP3P12645 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BMP3P12645 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BMP3P12645 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BMP3P12645 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BMP3P12645 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BMP3P12645 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BMP3P12645 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BMP3P12645 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BMP3P12645 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BMP3P12645 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BMP3P12645 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms