Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COX6A1P12074 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX6A1P12074 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX6A1P12074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX6A1P12074 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COX6A1P12074 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COX6A1P12074 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX6A1P12074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX6A1P12074 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX6A1P12074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX6A1P12074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms