Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFHP12036 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFHP12036 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFHP12036 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFHP12036 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFHP12036 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFHP12036 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFHP12036 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFHP12036 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFHP12036 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFHP12036 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFHP12036 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFHP12036 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFHP12036 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFHP12036 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFHP12036 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFHP12036 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFHP12036 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFHP12036 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFHP12036 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFHP12036 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFHP12036 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFHP12036 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFHP12036 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFHP12036 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFHP12036 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFHP12036 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFHP12036 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFHP12036 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFHP12036 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFHP12036 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFHP12036 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFHP12036 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFHP12036 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFHP12036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFHP12036 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFHP12036 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFHP12036 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFHP12036 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFHP12036 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFHP12036 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFHP12036 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFHP12036 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFHP12036 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFHP12036 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFHP12036 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFHP12036 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFHP12036 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFHP12036 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFHP12036 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFHP12036 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFHP12036 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFHP12036 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFHP12036 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFHP12036 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFHP12036 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFHP12036 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFHP12036 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFHP12036 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFHP12036 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFHP12036 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFHP12036 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFHP12036 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFHP12036 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFHP12036 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFHP12036 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFHP12036 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFHP12036 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFHP12036 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms