Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBL4AP11441 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4AP11441 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4AP11441 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275 ms