Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX5BP10606 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX5BP10606 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX5BP10606 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX5BP10606 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX5BP10606 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COX5BP10606 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COX5BP10606 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COX5BP10606 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COX5BP10606 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX5BP10606 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX5BP10606 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX5BP10606 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX5BP10606 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX5BP10606 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COX5BP10606 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX5BP10606 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COX5BP10606 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX5BP10606 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX5BP10606 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX5BP10606 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX5BP10606 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX5BP10606 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX5BP10606 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX5BP10606 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX5BP10606 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX5BP10606 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX5BP10606 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX5BP10606 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX5BP10606 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX5BP10606 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX5BP10606 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX5BP10606 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX5BP10606 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX5BP10606 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX5BP10606 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COX5BP10606 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX5BP10606 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX5BP10606 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX5BP10606 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX5BP10606 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX5BP10606 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COX5BP10606 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX5BP10606 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX5BP10606 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX5BP10606 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX5BP10606 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX5BP10606 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX5BP10606 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX5BP10606 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX5BP10606 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX5BP10606 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX5BP10606 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COX5BP10606 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX5BP10606 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX5BP10606 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX5BP10606 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX5BP10606 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX5BP10606 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms