Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LYNX1P0DP58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYNX1P0DP58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYNX1P0DP58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LYNX1P0DP58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms