Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3P09919 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3P09919 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3P09919 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3P09919 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3P09919 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF3P09919 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF3P09919 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF3P09919 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3P09919 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3P09919 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3P09919 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF3P09919 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF3P09919 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF3P09919 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF3P09919 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3P09919 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3P09919 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3P09919 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSF3P09919 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3P09919 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF3P09919 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF3P09919 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF3P09919 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3P09919 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF3P09919 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3P09919 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3P09919 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3P09919 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3P09919 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF3P09919 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3P09919 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3P09919 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF3P09919 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3P09919 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3P09919 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3P09919 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3P09919 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3P09919 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3P09919 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3P09919 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3P09919 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3P09919 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3P09919 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3P09919 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3P09919 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3P09919 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms