Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDHA1P08559 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDHA1P08559 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDHA1P08559 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDHA1P08559 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms