Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGPP08493 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGPP08493 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGPP08493 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGPP08493 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGPP08493 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGPP08493 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGPP08493 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGPP08493 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGPP08493 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGPP08493 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGPP08493 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGPP08493 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MGPP08493 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MGPP08493 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MGPP08493 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MGPP08493 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MGPP08493 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MGPP08493 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MGPP08493 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MGPP08493 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MGPP08493 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MGPP08493 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MGPP08493 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MGPP08493 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MGPP08493 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MGPP08493 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MGPP08493 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MGPP08493 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MGPP08493 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MGPP08493 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MGPP08493 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MGPP08493 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MGPP08493 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MGPP08493 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MGPP08493 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MGPP08493 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGPP08493 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGPP08493 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGPP08493 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MGPP08493 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms