Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPRAP08240 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRAP08240 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRAP08240 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRAP08240 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPRAP08240 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPRAP08240 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRAP08240 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRPRAP08240 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRAP08240 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms