Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKMP08237 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKMP08237 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKMP08237 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKMP08237 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKMP08237 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKMP08237 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKMP08237 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKMP08237 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFKMP08237 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKMP08237 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKMP08237 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKMP08237 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKMP08237 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKMP08237 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKMP08237 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKMP08237 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKMP08237 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKMP08237 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKMP08237 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKMP08237 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKMP08237 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKMP08237 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKMP08237 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKMP08237 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKMP08237 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKMP08237 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKMP08237 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKMP08237 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKMP08237 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKMP08237 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKMP08237 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PFKMP08237 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFKMP08237 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PFKMP08237 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PFKMP08237 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PFKMP08237 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PFKMP08237 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PFKMP08237 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PFKMP08237 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFKMP08237 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PFKMP08237 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PFKMP08237 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PFKMP08237 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PFKMP08237 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PFKMP08237 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PFKMP08237 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PFKMP08237 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKMP08237 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKMP08237 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKMP08237 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKMP08237 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKMP08237 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKMP08237 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKMP08237 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKMP08237 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKMP08237 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKMP08237 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKMP08237 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKMP08237 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKMP08237 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKMP08237 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms