Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTMAP06454 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTMAP06454 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTMAP06454 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTMAP06454 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTMAP06454 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTMAP06454 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTMAP06454 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTMAP06454 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTMAP06454 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTMAP06454 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTMAP06454 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTMAP06454 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTMAP06454 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTMAP06454 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTMAP06454 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTMAP06454 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTMAP06454 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTMAP06454 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTMAP06454 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTMAP06454 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTMAP06454 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTMAP06454 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTMAP06454 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTMAP06454 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTMAP06454 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTMAP06454 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTMAP06454 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTMAP06454 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTMAP06454 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTMAP06454 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTMAP06454 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTMAP06454 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTMAP06454 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTMAP06454 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTMAP06454 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTMAP06454 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTMAP06454 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTMAP06454 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTMAP06454 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTMAP06454 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTMAP06454 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTMAP06454 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTMAP06454 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTMAP06454 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTMAP06454 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTMAP06454 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTMAP06454 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTMAP06454 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTMAP06454 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTMAP06454 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTMAP06454 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTMAP06454 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTMAP06454 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTMAP06454 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTMAP06454 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTMAP06454 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTMAP06454 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTMAP06454 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTMAP06454 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTMAP06454 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTMAP06454 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTMAP06454 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTMAP06454 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTMAP06454 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTMAP06454 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTMAP06454 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTMAP06454 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTMAP06454 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTMAP06454 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTMAP06454 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTMAP06454 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTMAP06454 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTMAP06454 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTMAP06454 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTMAP06454 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTMAP06454 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTMAP06454 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTMAP06454 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTMAP06454 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTMAP06454 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMAP06454 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMAP06454 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMAP06454 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMAP06454 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMAP06454 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMAP06454 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMAP06454 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMAP06454 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMAP06454 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMAP06454 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMAP06454 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMAP06454 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms