Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB2P05107 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB2P05107 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB2P05107 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 836.5 ms