Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFNA4P05014 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA4P05014 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA4P05014 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA4P05014 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms