Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
A1BGP04217 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
A1BGP04217 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
A1BGP04217 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
A1BGP04217 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
A1BGP04217 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
A1BGP04217 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
A1BGP04217 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
A1BGP04217 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
A1BGP04217 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
A1BGP04217 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
A1BGP04217 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
A1BGP04217 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
A1BGP04217 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
A1BGP04217 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
A1BGP04217 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
A1BGP04217 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
A1BGP04217 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
A1BGP04217 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
A1BGP04217 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
A1BGP04217 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
A1BGP04217 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
A1BGP04217 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
A1BGP04217 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
A1BGP04217 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
A1BGP04217 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
A1BGP04217 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
A1BGP04217 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
A1BGP04217 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
A1BGP04217 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
A1BGP04217 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
A1BGP04217 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
A1BGP04217 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
A1BGP04217 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
A1BGP04217 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
A1BGP04217 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
A1BGP04217 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
A1BGP04217 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
A1BGP04217 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
A1BGP04217 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
A1BGP04217 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
A1BGP04217 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
A1BGP04217 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
A1BGP04217 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
A1BGP04217 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
A1BGP04217 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
A1BGP04217 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
A1BGP04217 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
A1BGP04217 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
A1BGP04217 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
A1BGP04217 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
A1BGP04217 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
A1BGP04217 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
A1BGP04217 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
A1BGP04217 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
A1BGP04217 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
A1BGP04217 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
A1BGP04217 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
A1BGP04217 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
A1BGP04217 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
A1BGP04217 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
A1BGP04217 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
A1BGP04217 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
A1BGP04217 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
A1BGP04217 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
A1BGP04217 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
A1BGP04217 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
A1BGP04217 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
A1BGP04217 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
A1BGP04217 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
A1BGP04217 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
A1BGP04217 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
A1BGP04217 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
A1BGP04217 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
A1BGP04217 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
A1BGP04217 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
A1BGP04217 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
A1BGP04217 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
A1BGP04217 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
A1BGP04217 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
A1BGP04217 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
A1BGP04217 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
A1BGP04217 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
A1BGP04217 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
A1BGP04217 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
A1BGP04217 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
A1BGP04217 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
A1BGP04217 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
A1BGP04217 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
A1BGP04217 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
A1BGP04217 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
A1BGP04217 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
A1BGP04217 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
A1BGP04217 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms