Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2P04141 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2P04141 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2P04141 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2P04141 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2P04141 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF2P04141 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2P04141 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2P04141 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2P04141 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2P04141 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2P04141 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF2P04141 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2P04141 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2P04141 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2P04141 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2P04141 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2P04141 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2P04141 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2P04141 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2P04141 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2P04141 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2P04141 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2P04141 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2P04141 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2P04141 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2P04141 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2P04141 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2P04141 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2P04141 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2P04141 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2P04141 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2P04141 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2P04141 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2P04141 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2P04141 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2P04141 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2P04141 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2P04141 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2P04141 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2P04141 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2P04141 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2P04141 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2P04141 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2P04141 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2P04141 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2P04141 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2P04141 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2P04141 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2P04141 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2P04141 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2P04141 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2P04141 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2P04141 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2P04141 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2P04141 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2P04141 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2P04141 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2P04141 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2P04141 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2P04141 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2P04141 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2P04141 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2P04141 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2P04141 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2P04141 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2P04141 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2P04141 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2P04141 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2P04141 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms