Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MT-ND2P03891 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MT-ND2P03891 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND2P03891 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms