Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIMP1P01033 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIMP1P01033 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIMP1P01033 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIMP1P01033 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TIMP1P01033 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIMP1P01033 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TIMP1P01033 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIMP1P01033 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIMP1P01033 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIMP1P01033 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TIMP1P01033 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIMP1P01033 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIMP1P01033 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TIMP1P01033 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TIMP1P01033 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TIMP1P01033 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TIMP1P01033 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TIMP1P01033 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TIMP1P01033 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TIMP1P01033 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TIMP1P01033 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMP1P01033 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms