Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
F2P00734 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F2P00734 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
F2P00734 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2P00734 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2P00734 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
F2P00734 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2P00734 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F2P00734 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2P00734 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2P00734 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2P00734 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2P00734 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F2P00734 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
F2P00734 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2P00734 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2P00734 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2P00734 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2P00734 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
F2P00734 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F2P00734 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F2P00734 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
F2P00734 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
F2P00734 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F2P00734 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F2P00734 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
F2P00734 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F2P00734 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
F2P00734 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
F2P00734 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
F2P00734 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
F2P00734 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F2P00734 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F2P00734 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F2P00734 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F2P00734 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F2P00734 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F2P00734 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
F2P00734 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F2P00734 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F2P00734 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F2P00734 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F2P00734 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F2P00734 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F2P00734 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F2P00734 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F2P00734 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F2P00734 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F2P00734 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F2P00734 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F2P00734 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F2P00734 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
F2P00734 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F2P00734 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F2P00734 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
F2P00734 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
F2P00734 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
F2P00734 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
F2P00734 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F2P00734 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
F2P00734 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F2P00734 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F2P00734 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F2P00734 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F2P00734 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F2P00734 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F2P00734 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F2P00734 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F2P00734 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
F2P00734 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
F2P00734 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
F2P00734 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
F2P00734 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
F2P00734 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
F2P00734 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F2P00734 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
F2P00734 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
F2P00734 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
F2P00734 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
F2P00734 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F2P00734 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
F2P00734 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
F2P00734 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
F2P00734 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F2P00734 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms