Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLIC3O95833 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC3O95833 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLIC3O95833 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms