Protein–RNA interactions for Protein: O95757

HSPA4L, Heat shock 70 kDa protein 4L, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4LO95757 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSPA4LO95757 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSPA4LO95757 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA4LO95757 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA4LO95757 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4LO95757 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms