Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSL3O95573 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSL3O95573 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACSL3O95573 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL3O95573 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1191.8 ms