Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MATN4O95460 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN4O95460 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN4O95460 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN4O95460 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN4O95460 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN4O95460 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN4O95460 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN4O95460 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN4O95460 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN4O95460 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN4O95460 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN4O95460 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN4O95460 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN4O95460 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN4O95460 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN4O95460 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN4O95460 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN4O95460 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN4O95460 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN4O95460 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN4O95460 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN4O95460 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN4O95460 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN4O95460 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN4O95460 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN4O95460 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN4O95460 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN4O95460 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN4O95460 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN4O95460 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN4O95460 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN4O95460 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN4O95460 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN4O95460 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN4O95460 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN4O95460 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN4O95460 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN4O95460 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN4O95460 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN4O95460 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN4O95460 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN4O95460 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN4O95460 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN4O95460 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN4O95460 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN4O95460 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN4O95460 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN4O95460 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN4O95460 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN4O95460 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN4O95460 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN4O95460 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN4O95460 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN4O95460 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN4O95460 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN4O95460 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN4O95460 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN4O95460 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN4O95460 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN4O95460 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN4O95460 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN4O95460 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN4O95460 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN4O95460 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MATN4O95460 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MATN4O95460 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MATN4O95460 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MATN4O95460 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN4O95460 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN4O95460 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN4O95460 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN4O95460 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN4O95460 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms