Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms