Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX4O95219 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX4O95219 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX4O95219 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX4O95219 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX4O95219 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX4O95219 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX4O95219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX4O95219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX4O95219 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX4O95219 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX4O95219 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX4O95219 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX4O95219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX4O95219 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX4O95219 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX4O95219 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX4O95219 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX4O95219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX4O95219 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX4O95219 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX4O95219 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX4O95219 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX4O95219 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX4O95219 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX4O95219 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX4O95219 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX4O95219 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX4O95219 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX4O95219 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX4O95219 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX4O95219 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX4O95219 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX4O95219 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX4O95219 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX4O95219 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX4O95219 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX4O95219 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX4O95219 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX4O95219 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX4O95219 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX4O95219 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX4O95219 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX4O95219 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX4O95219 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX4O95219 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX4O95219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX4O95219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX4O95219 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX4O95219 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX4O95219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX4O95219 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX4O95219 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX4O95219 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX4O95219 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX4O95219 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX4O95219 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX4O95219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX4O95219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX4O95219 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX4O95219 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX4O95219 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX4O95219 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX4O95219 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms