Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAMP5O95183 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP5O95183 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP5O95183 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP5O95183 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms