Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRPF40AO75400 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF40AO75400 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF40AO75400 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms