Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A1O75387 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A1O75387 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC43A1O75387 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms