Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPSNAP2O75323 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP2O75323 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP2O75323 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms