Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG13O75143 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG13O75143 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG13O75143 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG13O75143 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG13O75143 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG13O75143 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG13O75143 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG13O75143 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG13O75143 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG13O75143 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG13O75143 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG13O75143 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG13O75143 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG13O75143 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG13O75143 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG13O75143 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG13O75143 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG13O75143 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG13O75143 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG13O75143 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG13O75143 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG13O75143 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG13O75143 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG13O75143 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG13O75143 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG13O75143 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG13O75143 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG13O75143 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG13O75143 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG13O75143 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG13O75143 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG13O75143 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG13O75143 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG13O75143 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG13O75143 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG13O75143 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG13O75143 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG13O75143 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG13O75143 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG13O75143 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG13O75143 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG13O75143 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG13O75143 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG13O75143 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG13O75143 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG13O75143 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG13O75143 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG13O75143 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG13O75143 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG13O75143 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG13O75143 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG13O75143 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG13O75143 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG13O75143 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG13O75143 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG13O75143 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG13O75143 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG13O75143 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG13O75143 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG13O75143 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG13O75143 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG13O75143 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG13O75143 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG13O75143 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG13O75143 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG13O75143 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG13O75143 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG13O75143 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG13O75143 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG13O75143 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG13O75143 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG13O75143 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms