Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN2BO60939 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN2BO60939 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN2BO60939 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN2BO60939 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms