Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR5O60602 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR5O60602 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR5O60602 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR5O60602 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR5O60602 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR5O60602 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR5O60602 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR5O60602 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR5O60602 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR5O60602 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR5O60602 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR5O60602 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR5O60602 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR5O60602 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR5O60602 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR5O60602 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR5O60602 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR5O60602 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR5O60602 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR5O60602 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR5O60602 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR5O60602 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR5O60602 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR5O60602 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR5O60602 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR5O60602 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR5O60602 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR5O60602 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR5O60602 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR5O60602 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR5O60602 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR5O60602 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR5O60602 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR5O60602 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR5O60602 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR5O60602 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR5O60602 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR5O60602 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR5O60602 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR5O60602 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR5O60602 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR5O60602 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR5O60602 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR5O60602 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR5O60602 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR5O60602 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TLR5O60602 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR5O60602 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLR5O60602 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLR5O60602 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLR5O60602 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR5O60602 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR5O60602 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLR5O60602 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR5O60602 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR5O60602 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR5O60602 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR5O60602 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR5O60602 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR5O60602 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR5O60602 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR5O60602 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR5O60602 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR5O60602 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR5O60602 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR5O60602 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR5O60602 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR5O60602 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR5O60602 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR5O60602 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR5O60602 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR5O60602 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR5O60602 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR5O60602 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR5O60602 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR5O60602 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR5O60602 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR5O60602 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR5O60602 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR5O60602 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR5O60602 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR5O60602 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR5O60602 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR5O60602 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TLR5O60602 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR5O60602 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR5O60602 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR5O60602 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR5O60602 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR5O60602 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR5O60602 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR5O60602 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms