Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNT1O60563 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNT1O60563 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNT1O60563 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms