Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME2P1O60361 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME2P1O60361 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME2P1O60361 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME2P1O60361 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms