Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB2O60315 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZEB2O60315 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB2O60315 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms