Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD5O60279 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD5O60279 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD5O60279 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD5O60279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms