Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR3O43761 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR3O43761 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR3O43761 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms