Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP8B1O43520 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP8B1O43520 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP8B1O43520 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms