Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREHO43280 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREHO43280 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREHO43280 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TREHO43280 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREHO43280 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREHO43280 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREHO43280 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TREHO43280 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TREHO43280 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREHO43280 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TREHO43280 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TREHO43280 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TREHO43280 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TREHO43280 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TREHO43280 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TREHO43280 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TREHO43280 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TREHO43280 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREHO43280 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREHO43280 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TREHO43280 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREHO43280 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREHO43280 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TREHO43280 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TREHO43280 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TREHO43280 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TREHO43280 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TREHO43280 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TREHO43280 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TREHO43280 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TREHO43280 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TREHO43280 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TREHO43280 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TREHO43280 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TREHO43280 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TREHO43280 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TREHO43280 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TREHO43280 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TREHO43280 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREHO43280 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREHO43280 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREHO43280 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREHO43280 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREHO43280 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TREHO43280 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TREHO43280 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TREHO43280 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TREHO43280 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TREHO43280 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TREHO43280 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TREHO43280 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TREHO43280 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TREHO43280 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TREHO43280 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TREHO43280 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TREHO43280 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TREHO43280 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TREHO43280 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TREHO43280 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TREHO43280 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TREHO43280 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
TREHO43280 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TREHO43280 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TREHO43280 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TREHO43280 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TREHO43280 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TREHO43280 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TREHO43280 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TREHO43280 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TREHO43280 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TREHO43280 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TREHO43280 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TREHO43280 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TREHO43280 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TREHO43280 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms