Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODHO43272 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODHO43272 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODHO43272 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRODHO43272 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODHO43272 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODHO43272 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODHO43272 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODHO43272 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRODHO43272 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODHO43272 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODHO43272 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODHO43272 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRODHO43272 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODHO43272 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODHO43272 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODHO43272 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRODHO43272 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODHO43272 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODHO43272 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODHO43272 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODHO43272 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODHO43272 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRODHO43272 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRODHO43272 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODHO43272 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODHO43272 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODHO43272 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODHO43272 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODHO43272 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRODHO43272 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODHO43272 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODHO43272 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODHO43272 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODHO43272 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRODHO43272 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODHO43272 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODHO43272 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRODHO43272 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRODHO43272 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRODHO43272 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODHO43272 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODHO43272 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODHO43272 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODHO43272 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRODHO43272 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRODHO43272 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRODHO43272 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODHO43272 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODHO43272 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODHO43272 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODHO43272 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODHO43272 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRODHO43272 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRODHO43272 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODHO43272 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODHO43272 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODHO43272 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODHO43272 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODHO43272 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODHO43272 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODHO43272 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODHO43272 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODHO43272 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODHO43272 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODHO43272 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODHO43272 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODHO43272 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODHO43272 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODHO43272 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODHO43272 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODHO43272 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODHO43272 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODHO43272 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODHO43272 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODHO43272 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRODHO43272 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODHO43272 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODHO43272 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODHO43272 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODHO43272 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms