Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP8O43159 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP8O43159 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP8O43159 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP8O43159 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP8O43159 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP8O43159 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP8O43159 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP8O43159 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP8O43159 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP8O43159 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP8O43159 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP8O43159 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP8O43159 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP8O43159 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP8O43159 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP8O43159 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP8O43159 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP8O43159 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP8O43159 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP8O43159 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP8O43159 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP8O43159 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP8O43159 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP8O43159 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP8O43159 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP8O43159 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP8O43159 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP8O43159 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP8O43159 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP8O43159 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP8O43159 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP8O43159 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP8O43159 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP8O43159 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP8O43159 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP8O43159 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP8O43159 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP8O43159 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP8O43159 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP8O43159 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms